Determina que finalizado el procedimiento de verificación documental e inspección física de las mercancías pecuarias el Inspector de cuarentena animal procederá a otorgar el Documento de Autorización de Internamiento al País, documento que en el Ecuador se lo conoce como Documento de Destinación Aduanera. 

La presente Ley regula la sanidad agropecuaria, mediante la aplicación de medidas para prevenir el ingreso, diseminación y establecimiento de plagas y enfermedades; promover el bienestar animal, el control y erradicación de plagas y enfermedades que afectan a los vegetales y animales y que podrían representar riesgo fito y zoosanitario. Regula también el desarrollo de actividades, servicios y la aplicación de medidas fito y zoosanitarias,
con base a los principios técnico-científicos para la protección y mejoramiento de la sanidad animal y vegetal, así como para el incremento de la producción, la productividad y garantía de los derechos a la salud y a la vida; y el aseguramiento de la calidad de los productos agropecuarios, dentro de los
objetivos previstos en la planificación, los instrumentos internacionales en materia de sanidad agropecuaria, que forman parte del ordenamiento jurídico nacional.

Este manual general describe el procedimiento administrativo y técnico que deben seguir los usuarios y el personal de la Agencia, para la verificación, inspección, aprobación, nacionalización o establecimiento de una medida sanitaria respectoa la importación de mercancías pecuarias, desde los procesos previos a la importación hasta la autorización definitiva de ingreso de la mercadería o la aplicación de la medida sanitaria necesaria a fin de que desarrollen sus actividades, basándose en conocimientos que les permitan entender de mejor manera su accionar técnico en defensa del patrimonio pecuario nacional.

El presente Reglamento tiene por objeto instrumentar normas y procedimientos parala correcta aplicación de la Ley Orgánica de Sanidad Agropecuaria.